Αν και πρόκειται για ένα μικρό νησί με λίγοστούς κατοίκους, η Φολέγανδρος είναι ιδιαίτερα γνωστή για τα τοπικά της προϊόντα. Αξίζει να γευτείτε το μέλι με το έντονο θυμαρίσιο άρωμα που παράγεται και πωλείται από τους τοπικούς παραγωγούς. Ιδιαίτερα γευστικά είναι τα τοπικά τυριά που μπορείτε να βρείτε στη Φολέγανδρο. Το πιο γνωστό από αυτά είναι το Σουρωτό και πρόκειται για ένα λευκό τυρί με μαλακή υφή που ταιριάζει πολύ με τη σαλάτα. Υπάρχει ακόμα και το Σκληρό που οι ντόπιοι απλά το αποκαλούν «τυρί» και συνηθίζουν να το τρίβουν στα μακαρόνια. Τέλος, το Μελίχλωρο ξεπλένεται στη θάλασσα και καταναλωνεται τους μήνες Απρίλιο και Μάιο.

Αν είστε τυχεροί και είστε καλεσμένοι σε γάμο ή βάφτιση σε κάποια από τις όμορφες εκκλησίες του νησιού, θα σας προσφέρουν αντί για κουφέτα ντόπιο παστέλι με μέλι του νησιού. Μην αμελήσετε να δοκιμάσετε τη γλυκιά πίτα του νησιού που ονομάζεται Καρπουζένια και φτιάχνεται με καρπούζι, μέλι και σουσάμι. Μία ακόμα τοπική γεύση είναι η Καλασούνα και πρόκειται για νόστιμη τυρόπιτα φτιαγμένη με σουρωτό. Τέλος, κύριο χαρακτηριστικό της κουζίνας του νησιού είναι τα παραδοσιακά χειροποίητα μακαρόνια, γνωστά ως ματσάτα που σερβίρονται σε όλες τις ταβέρνες της Φολεγάνδρου συνοδεύοντας κυρίως κοκκινιστό κόκκορα. Μη φύγετε από το νησί αν δεν τα έχετε δοκιμάσει!